На водосборе, кроме г. Дмитров, находится 249 населенных пунктов, сброс сточных вод из которых частично осуществляется как непосредственно в Яхрому, так и в ее притоки. Сведения о наличии в них очистных сооружений и объемах точечных источников отсутствуют. Также в бассейне имеются 196 садовых некоммерческих товариществ (СНТ), которые являются источниками диффузного загрязнения.

В районе 58 крестьянских (фермерских) хозяйств, которые производят 15 тыс. тонн картофеля и овощей, 350 т. молока и другую сельскохозяйственную продукцию. Ведущие предприятия района:

• Агрохолдинг «Дмитровские овощи» (входят хозяйства: ООО «Фрухтринг», ЗАО «Агрофирма «Бунятино», ООО «Дмитровские овощи») – один из крупнейших сельхозпроизводителей района, обеспечивающий замкнутый круг деятельности: выращивание, переработку, хранение и поставку свежей и переработанной продукции свыше 200 клиентам Москвы и Подмосковья. Здесь самая большая посевная площадь под овощами и картофелем 2802 га или 38% от всех площадей с/х предприятий района и 12,5% от Московской области;
• ФГУ СПО МО «Яхромский аграрный колледж» – старейшее предприятие района, основанное в 1958 г., производит картофель и овощи – до 30 тыс. т., зерно – 1 тыс. т., молоко – 2 тыс. т;
• ООО «Агронавт» и ЗАО «Куликово» крупные хозяйства, которые производят ежегодно по 45 тыс. тонн картофеля и овощей.

Исходные данные для расчета диффузного загрязнения, помещенные на почвенной карте